Varian Omicron: Seberapa Parah dan Apa yang Perlu Kita Waspadai

Varian Omicron: Seberapa Parah dan Apa yang Perlu Kita Waspadai
Varian omicron, varian lain dari virus penyebab Covid-19, menimbulkan kekhawatiran baru terkait penyakit yang mewabah sejak 2019 ini. (Foto: Freepik)
Bagikan ke Teman:

Awal Desember lalu, para ilmuwan dari Botswana dan Afrika Selatan memperingatkan dunia tentang virus SARS-CoV-2 baru yang menyebar dengan cepat dan dinamakan varian Omicron. Para peneliti di seluruh dunia bergegas untuk memahami ancaman dari varian baru ini. Omicron saat ini sudah menyebar ke 20 negara. Namun, sepertinya para ilmuwan masih membutuhkan waktu sedikit lebih lama untuk mendapatkan gambaran lengkap terkait Omicron, dan lebih memahami proses penyebaran dan tingkat keparahannya, serta kemungkinannya untuk berkelit dari vaksin dan menyebabkan infeksi berulang.

“Kemanapun saya pergi, orang-orang mengatakan: jelaskan pada kami tentang Omicron,” ujar Senjuti Saha, pakar mikrobiologi molekular dan direktur dari Child Health Research Foundation di Dhaka, Bangladesh. “Masih sangat sedikit pemahaman tentang apa yang sedang terjadi, dan hal ini juga berlaku bagi para peneliti.”

Nature menyimpulkan apa yang telah diketahui oleh para peneliti sejauh ini terkait varian Omicron.

Seberapa Cepat Omicron Menyebar?

Apa yang paling dikhawatirkan oleh peneliti adalah peningkatan pesat varian Omicron di Afrika Selatan, karena hal ini menunjukkan varian ini bisa memicu ledakan peningkatan infeksi Covid-19 di tempat lain. Pada tanggal 1 Desember lalu, Afrika Selatan mencatat 8.561 kasus, meningkat dari 3.402 laporan pada tanggal 26 November dan beberapa ratus per hari pada pertengahan November. Peningkatan ini terutama terjadi di Provinsi Gauteng, tempat kota Johannesburgh berada.

Pakar epidemiologi mengukur suatu pertumbuhan epidemik menggunakan R, angka rata-rata kasus baru yang dicetuskan oleh setiap infeksi. Pada akhir November, National Institute for Communicable Diseases (NICD) Afrika Selatan di Johannesburg menetapkan bahwa R di atas 2 di Gauteng. Level peningkatan ini terakhir kali ditemukan pada hari-hari awal pandemi, menurut penjelasan Richard Lessells, seorang dokter penyakit infeksi di University of KwaZulu-Natal di Durban, Afrika Selatan pada briefing pers awal Desember lalu.

Tingat R di Gauteng ada di bawah 1 pada awal September–ketika varian Delta mendominasi dan jumlah kasus menurun–yang menunjukkan varian Omicron berpotensi menyebar lebih cepat dan menginfeksi lebih banyak orang dibanding Delta, ujar Tom Wenseleers, seorang pakar biologi evolusi di Catholic University of Leuven di Belgia. Berdasarkan peningkatan kasus Covid-19 dan pengurutan data, Wenseleers memperkirakan Omicron bisa menginfeksi tiga sampai enam kali lebih banyak dibanding Delta, dalam rentang waktu yang sama. “Ini adalah keuntungan besar bagi virus itu–tapi tidak untuk kita,” tambahnya.

Peneliti akan mengamati bagaimana varian Omicron menyebar di area lain di Afrika Selatan dan global untuk memahami lebih dalam tentang kemampuan penularannya, ujar Christian Althaus, pakar epidemiologi komputasi di University of Bern, Swiss. Peningkatan pengawasan di Afrika Selatan bisa juga menyebabkan peneliti menaksir terlalu tinggi peningkatan pesat varian Omicron. Tapi jika pola ini berulang di negara lain, maka itu akan menjadi bukti kuat bahwa Omicron memiliki tingkat penyebaran yang lebih tinggi, tambah Althaus. “Jika hal ini tidak terjadi di, misalnya, negara-negara Eropa, artinya hal ini lebih kompleks dan sangat bergantung pada lanskap imunologis. Jadi kita perlu menunggu.”

Meskipun pengurutan genom diperlukan untuk mengkonfirmasi kasus Omicron, beberapa tes PCR dapat mengambil ciri dari varian yang membedakannya dari Delta. Berdasarkan sinyal ini, ada indikasi awal bahwa kasus, meskipun jumlahnya sangat rendah, meningkat di Inggris. “Itu tentu bukan yang ingin kami lihat sekarang dan menunjukkan bahwa Omicron memang bisa memiliki keunggulan transmisi di Inggris,” tambah Althaus.

Bisakah Varian Omicron Mengatasi Kekebalan dari Vaksin atau Infeksi?

Peningkatan pesat varian Omicron di Afrika Selatan memberi sinyal bahwa virus ini memiliki kemampuan untuk menghindari imunitas. Sekitar seperempat penduduk Afrika Selatan telah divaksin, dan ada kemungkinan besar pecahan besar dari populasi terinfeksi SARS-Cov-2 pada gelombang awal, ujar Wenseleers, berdasarkan meningkatnya tingkat kematian sejak mulainya pandemi.

Pada konteks ini, suksesnya Omicron di selatan Afrika bisa jadi sebagian besar karena kapasitasnya untuk menginfeksi mereka yang telah sembuh dari Covid-19 yang disebabkan oleh Delta atau varian lainnya, hal ini juga berlaku bagi mereka yang sudah divaksin. Data dari NICD yang dikeluarkan pada tanggal 2 Desember 2021 menemukan, infeksi ulang di Afrika Selatan meningkat seiring penyebaran Omicron. “Sayangnya, lingkungan ini sempurna bagi varian yang bisa menghindari imunitas untuk berkembang,” ujar Althaus.

Seberapa tinggi penyebaran varian Omicron di tempat lain akan bergantung pada berbagai faktor seperti vaksinasi dan tingkat infeksi sebelumnya, ujar Aris Katzourakis, peneliti infeksi viral di University of Oxford, Inggris. “Jika Anda melemparkannya di populasi dengan tingkat vaksinasi yang tinggi dan telah melonggarkan beberapa tindak pengendalian, varian ini bisa memperoleh keuntungan di sana.”

Peneliti ingin mengukur kemampuan Omicron untuk menghindari respons imun dan perlindungan yang diberikan. Misalnya, tim yang dipimpin oleh Penny Moore, ahli virologi di NICD dan Universitas Witwatersrand di Johannesburg, mengukur kemampuan menetralkan, atau memblokir virus, antibodi yang dipicu oleh infeksi dan vaksinasi sebelumnya untuk menghentikan Omicron menginfeksi sel. Untuk menguji ini di laboratorium, timnya membuat partikel ‘pseudovirus’ – versi rekayasa HIV yang menggunakan protein lonjakan SARS-CoV-2 untuk menginfeksi sel – yang cocok dengan Omicron, yang menampung sebanyak 32 perubahan untuk lonjakan.

Tim Afrika Selatan lain, dipimpin oleh Alex Sigal dari Afrika Health Research Institute di Durban, melakukan tes serupa melakukan tes serupa terhadap antibodi penetral virus menggunakan partikel SARS-CoV-2 yang menular. Begitu juga dengan tim yang dipimpin oleh Pei-Yong Shi, ahli virologi di University of Texas Medical Branch di Galveston, yang bekerja sama dengan pembuat vaksin Pfizer–BioNTech untuk menentukan bagaimana vaksin itu bertahan melawan Omicron. “Saya benar-benar sangat prihatin ketika saya melihat konstelasi mutasi melonjak,” katanya. “Kami hanya harus menunggu hasilnya.”

Berbagai studi tentang pelonjakan mutasi Omicron sebelumnya–terutama di area yang mengenali reseptor sel manusia–menyimpulkan bahwa varian ini akan menumpulkan potensi penetralan antibodi. Contohnya, dalam makalah Nature bulan September 2021, satu tim yang dikepalai oleh Paul Bieniasz, seorang pakai virologi di Rockefeller University, New York City, merekayasa versi lonjakan yang sangat bermutasi — dalam virus yang tidak mampu menyebabkan COVID-19 — yang berbagi banyak mutasi dengan Omicron. ‘Lonjakan polimutan’ terbukti sepenuhnya tahan terhadap antibodi penawar dari sebagian besar orang yang mereka uji, yang telah menerima dua dosis vaksin mRNA atau pulih dari COVID-19. Dengan Omicron, “kami berharap akan ada hit yang signifikan”, kata Bieniasz.

Seberapa Kuat Vaksin Melindungi Lawan Varian Omicron?

Jika Omicron bisa menghindar dari antibodi penetral, ini bukan berarti respons imun yang dipicu oleh vaksin dan infeksi sebelumnya tidak lagi memberikan perlindungan melawan varian ini. Studi kekebalan menunjukkan bahwa tingkat antibodi penetralisir yang sederhana dapat melindungi orang dari bentuk COVID-19 yang parah, kata Miles Davenport, seorang ahli imunologi di University of New South Wales di Sydney, Australia.

Aspek lain dari sistem kekebalan, terutama sel T, bisa jadi lebih tidak terpengaruh oleh mutasi Omicron dibanding repons kekebalan. Peneliti di Afrika Selatan berencana untuk mengukur aktivitas sel T dan pemeran kekebalan lain yang disebut sel pembunuh alami, yang bisa jadi sangat penting dalam perlindungan melawan Covid-19 yang parah, ujar Shabir Madhi, seorang ahli vaksinologi di University of Witwatersrand.

Madhi, yang memimpin uji coba vaksin Covid-19 di Afrika Selatan, juga ambil bagian dalam upaya pengujian epidemilogis terkait efektivitas vaksin melawan Omicron. Ada laporan anekdotal tentang infeksi terobosan yang melibatkan ketiga vaksin yang telah diberikan di Afrika Selatan — Johnson & Johnson, Pfizer–BioNTech dan Oxford–AstraZeneca. Tetapi Madhi mengatakan para peneliti ingin mengukur tingkat perlindungan terhadap Omicron yang diberikan oleh vaksin, serta oleh infeksi sebelumnya.

Dia menduga bahwa hasilnya akan mengingatkan bagaimana vaksin AstraZeneca–Oxford bekerja melawan varian Beta, varian yang menghindari kekebalan yang diidentifikasi di Afrika Selatan pada akhir 2020. Sebuah uji coba yang dipimpin oleh Madhi menemukan bahwa vaksin tersebut menawarkan sedikit perlindungan terhadap infeksi ringan dan penyakit sedang, sementara analisis dunia nyata di Kanada menunjukkan perlindungan lebih dari 80% terhadap rawat inap.

Jika Omicron berperilaku serupa, kata Madhi, “kita akan melihat lonjakan kasus. Kita akan melihat banyak terobosan infeksi, banyak infeksi ulang. Tetapi akan ada penurunan tingkat kasus di masyarakat dibandingkan dengan tingkat rawat inap”. Laporan awal menunjukkan bahwa sebagian besar infeksi terobosan dengan Omicron ringan, kata Madhi. “Bagi saya, itu adalah sinyal positif.”

Apakah Booster Saat Ini Memperbaiki Perlindungan Lawan Omicron?

mixing vaksin covid-19
Dengan semakin banyaknya merek vaksin untuk virus Corona, muncul tindakan mixing vaksin Covid-19 yang menyuntikkan dua dosis vaksin berbeda. (Foto: The Telegraph)

Ancaman Omicron telah mendorong beberapa negara kaya, seperti Inggris, untuk mempercepat dan memperluas pemberian dosis booster vaksin Covid-19. Namun masih belum jelas seberapa efektif dosis ini melawan varian Omicron.

Dosis ketiga meningkatkan tingkat antibodi penetralisir, dan kemungkinan akan memberikan benteng terhadap kemampuan Omicron untuk menghindari antibodi ini, kata Bieniasz. Pekerjaan timnya pada lonjakan polimutan menemukan bahwa orang yang telah pulih dari COVID-19 beberapa bulan sebelum menerima suntikan memiliki antibodi yang mampu memblokir lonjakan mutan. Bagi Bieniasz, hasil tersebut menunjukkan bahwa orang dengan paparan berulang terhadap protein lonjakan SARS-CoV-2, baik melalui infeksi atau dosis booster, “sangat mungkin memiliki aktivitas penetralan terhadap Omicron”.

Apakah Omicron Menyebabkan Penyakit yang Lebih Parah atau Lebih Ringan?

Laporan sebelumnya menghubungkan Omicron dengan penyakit ringan, meningkatkan harapan bahwa varian ini lebih tidak parah dibanding pendahulunya. Namun laporan-laporan ini–yang seringnya berdasarkan data anekdotal–bisa menyesatkan, Müge Çevik, seorang pakar penyakit infeksi dari University of St Andrews, Inggris, memperingatkan. “Semua orang berusaha untuk menemukan data yang bisa memandu kita,” ujarnya. “Tapi hal ini sangatlah susah sekarang.”

Tantangan utama saat menilai keparahan varian adalah bagaimana mengontrol banyak variabel pengganggu yang dapat mempengaruhi perjalanan penyakit, terutama ketika wabah terlokalisasi secara geografis. Misalnya, laporan penyakit ringan dari infeksi Omicron di Afrika Selatan dapat mencerminkan fakta bahwa negara tersebut memiliki populasi yang relatif muda, banyak di antaranya telah terpapar SARS-CoV-2.

Selama hari-hari awal wabah Delta, ada laporan bahwa varian tersebut menyebabkan penyakit yang lebih serius pada anak-anak daripada varian lainnya – satu anggapan yang buyar setelah lebih banyak data dikumpulkan, kata Çevik.

Peneliti akan mencari data tentang infeksi varian Omicron di negara-negara lain. Penyebaran geografis ini, dan sampel dalam ukuran yang lebih besar seiring kasus bertambah, akan memberi para peneliti ide yang lebih baik tentang bagaimana laporan awal penyakit ringan dapat digeneralisasikan.

Pada akhirnya, peneliti ingin melakukan studi kasus terkontrol, di mana dua kelompok peserta dicocokkan dalam beberapa faktor penting seperti usia, status vaksinasi, dan kondisi kesehatan. Data dari kedua kelompok perlu dikumpulkan secara bersamaan, karena jumlah rawat inap dapat dipengaruhi oleh kapasitas rumah sakit secara keseluruhan di suatu wilayah.

Dan, yang terpenting, para peneliti perlu mengontrol tingkat kekurangan ekonomi. Varian baru yang menyebar dengan cepat dapat menjangkau kelompok rentan lebih cepat, kata evik, berdasarkan kondisi pekerjaan atau kehidupan mereka. Dan kelompok seperti itu sering mengalami penyakit yang lebih parah.

Semua ini akan memakan waktu. “Saya pikir pertanyaan tingkat keparahan akan menjadi salah satu bagian terakhir yang dapat kita uraikan,” katanya. “Begitulah yang terjadi dengan Delta.”

Dimana Omicron Menyebar?

Lebih banyak negara yang mendeteksi varian Omicron, tetapi kapasitas untuk mengurutkan virus dengan cepat dari tes positif COVID-19 terkonsentrasi di negara-negara kaya, yang berarti bahwa data awal tentang penyebaran Omicron akan tidak pasti.

Upaya pengawasan di Brasil dan beberapa negara lain mengambil keuntungan dari hasil yang berbeda pada tes PCR tertentu yang dapat memungkinkan mereka untuk menentukan kasus Omicron potensial untuk diurutkan, kata ahli virus Renato Santana di Universitas Federal Minas Gerais di Brasil. Tes ini mencari segmen dari tiga gen virus, salah satunya adalah gen yang mengkode protein lonjakan. Mutasi pada gen lonjakan Omicron mencegah pendeteksiannya saat pengujian, yang berarti bahwa sampel yang mengandung varian ini akan diuji positif hanya untuk dua gen.

Meski begitu, tidak semua orang menggunakan tes itu dan butuh beberapa waktu sebelum penyebaran Omicron dipetakan sepenuhnya. Meskipun beberapa pedoman mendesak negara-negara untuk mengurutkan 5% dari sampel mereka yang dites positif untuk SARS-CoV-2, hanya sedikit yang mampu melakukannya, kata ahli virologi komputasi Anderson Brito di All for Health Institute di São Paulo, Brasil. Dan Brito khawatir bahwa larangan perjalanan yang diberlakukan oleh beberapa negara terhadap Afrika Selatan, dan negara-negara di selatan Afrika lainnya, setelah penemuan Omicron dapat mencegah pemerintah berbagi data pengawasan genom. “Kita menghukum mereka yang melakukan pekerjaan dengan baik,” katanya.

Di Bangladesh, yang mengurutkan sekitar 0,2% sampel virus corona positif, para peneliti akan bersemangat untuk meningkatkan pengurutan untuk mengawasi Omicron dan varian lain yang muncul, kata Saha. Tetapi sumber daya terbatas. Bangladesh sedang memulihkan diri dari wabah demam berdarah yang besar, tambahnya. “Di belahan bumi selatan, kita semua khawatir tentang COVID, tetapi jangan lupakan penyakit endemik kita,” kata Saha. “Kami hanya bisa melakukan begitu banyak.”

Program Vaksin Triasse

pilihan untuk mencegah dan mengobati Covid-19
Triasse menyediakan program vaksinasi khusus karyawan sebagai pilihan pencegahan Covid-19. (Foto: Freepik)

Meningat laporan sudah ditemukannya kasus terinfeksi varian Omicron di Indonesia, Triasse mencoba membantu menekan dan menurunkan jumlah orang yang terinfeksi melalui program vaksinasi. Menggunakan vaksin Sinopharm yang memiliki efikasi sampai 79 persen, perusahaan kini bisa mengikuti Program Vaksin Gotong Royong yang diadakan oleh Triasse bersama Kimia Farma.

Program vaksin khusus karyawan perusahaan ini diharapkan bisa membantu menstabilkan dan menekan jumlah pasien Covid-19 di Indonesia sambil menjaga produktivitas dan kinerja karyawan dan perusahaan.

Selain itu, ada baiknya untuk lakukan pemeriksaan kesehatan sebelumnya. Medical check-up bisa mengurangi efek samping vaksin dan juga memastikan kondisi tubuh siap untuk menerima vaksinasi yang akan diberikan. Perlu diketahui, beberapa kondisi kesehatan seperti epilepsi, darah tinggi, orang dengan HIV, dan beberapa lainnya membutuhkan perhatian khusus sebelum menerima vaksin Covid-19.

Lakukan medical check-up pra-vaksin ini sekitar 7 hari sebelum Anda berencana akan melakukan vaksinasi. Hasil bisa didapatkan tiga hari setelah pengecekan.

Untuk lebih jelasnya, cek di sini. Pastikan juga untuk selalu melakukan pemeriksaan kesehatan secara rutin secara berkala dua kali dalam setahun. Cek berbagai paket pemeriksaan lainnya di Triasse sesuai dengan kebutuhan.

Bagikan ke Teman:
Nilam Suri
Sebelum menjadi Content Manager di Triasse, Nilam bekerja di beberapa media terbesar di Indonesia dengan spesialisasi di bidang kesehatan, gaya hidup, dan hiburan. Lulus dari Fakultas Ilmu Pengetahuan Budaya, Universitas Indonesia jurusan Cultural Studies dan Sastra Inggris.